La Cisse est une rivière française traversant les départements d'Indre-et-Loire et de Loir-et-Cher, affluent de rive droite de la Loire.
La rivière prend sa source sur la commune de Rhodon en Loir-et-Cher, dans la Beauce blésoise (petite Beauce).
Elle se sépare en deux parties à Chouzy-sur-Cisse : un premier bras se jette dans la Loire près de Chouzy, l'autre bras rejoint la Loire à Vouvray en Indre-et-Loire.
Sa longueur totale est de 81 km.
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