L'Orain est une rivière française qui coule dans le département du Jura, dans la région Bourgogne-Franche-Comté, et un affluent gauche du Doubs, donc un sous-affluent du Rhône par la Saône.
L'Orain prend naissance sur le territoire de la ville de Poligny, à 332 mètres d'altitude, dans le département du Jura, à moins de 10 kilomètres au sud-sud-ouest d'Arbois.
Il a 39,3 km de longueur.